2021-11-25
氮(N)循环是地球生态系统中重要的生物地球化学途径的集合,在生态学和环境研究中得到了广泛的关注。目前,鸟枪法宏基因组测序Shotgun metagenome sequencing已被广泛应用于探索负责 N 循环过程的基因家族。NCycDB是
2021-11-12
向NCBI提交基因簇的时候需要提供sqn格式的文件,这个文件需要通过tbl2asn生成。
文件准备tbl2asn依赖三个文件来生成sqn文件:
文件1:fasta格式的基因组序列文件
Header处的中括号部分可以不写。
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2021-11-02
devtools安装错误XML包 安装之 ERROR: configuration failed for package ‘XML’
CentOS解决方案
在Linux终端中运行如下命令即可:
1sudo yum install -y li
2021-11-02
本文演示如何在CentOS7服务器上安装Rstudio server。
安装Rstudio访问Rstudio官网,选择对应的Linux发行版,下载Rstudio安装包。本文以最常见的CentOS7为例演示,前提是系统中已经安装了R。
12w
2021-10-30
配置网卡接口eth0:
进入配置文件所在目录,并在超级用户权限下编辑网络配置对应的文件(不同的机器文件名可能不一样)。
123cd /etc/sysconfig/network-scriptsvim ifcfg-enp4s0f0
内容如下
2021-10-20
有时候需要在FASTA格式的文件中搜索短的保守序列,这个时候采用查找法比使用blast等序列比对更加人性化。但是要注意避坑,即FASTA文档中的序列一般是被打断为许多行的,如果要查找的目标序列恰好在断行处,是没有办法直接揪出它的,所以在查找
2021-10-19
sakuraplus主题默认是不显示表格边框的,而且对于比较宽的表格容易溢出,使得布局不美观。表格边框可以修改CSS来添加,较宽的表格可以通过添加滚动条来控制其不溢出,说起来简单,但是中间有很多坑,特此记录。
添加表格边框该主题默认的sty
2021-10-14
Subtitle: Predict Secretory Protein in microbes with SignalP and TMHMM
分泌蛋白Secretory Protein是指在细胞内合成后,分泌到细胞外起作用的蛋白质。分泌蛋白
2021-10-13
III 型分泌系统 (Type III secretion system,T3SS) 主要是革兰氏阴性菌的分泌蛋白分泌到细胞外的运输途径,T3SS效应蛋白 (Type III secretion system Effector protei
2021-10-12
气泡图是经常用到的一种图,可以对比不同样本中某个特征的丰富度差异。以下代码“bubbleChart_No0.R”用于气泡图的绘制,零值将不会在图中输出。
bubbleChart_No0.R代码在此123456789101112131415