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Ubuntu open-mpi运行错误
发表于:2019-03-30 | 分类: IT
字数统计: 164 | 阅读时长: 1分钟 | 阅读量:

我在 win10 Linux 子系统下使用 mpirun 多线程运行 ABySS 基因组拼接软件的时候,出现以下错误提示:

Linux kernel CMA support was requested via the btl_vader_single_copy_mechanism MCA variable, but CMA support is not available due to restrictive ptrace settings.

[liaochenlanruo:49950] 4 more processes have sent help message help-mpi-btl-openib-cpc-base.txt / ibv_create_qp failed

[liaochenlanruo:49950] Set MCA parameter "orte_base_help_aggregate" to 0 to see all help / error messages 

结果就是无法运行多线程,跑了一夜的程序没有任何动静,似乎是卡死了。


Google到的解决方案,root用户下,终端运行如下命令:
#echo 0 > /proc/sys/kernel/yama/ptrace_scope

**提示:"ptrace_scope"文件中原来的值为“1”,改成“0”就可以了。**
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