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R语言自定义坐标轴排序
发表于:2019-02-22 | 分类: 可视化
字数统计: 271 | 阅读时长: 1分钟 | 阅读量:

R 语言作图时,默认情况下软件会按照自己的方式对坐标轴的项目进行排序,然而这种排序往往不是我们所希望的,因此需要想办法让坐标轴的项目按照我们希望的顺序输出。

如下所示,我有两列数据,要绘制箱线图,以第一列为 Y 轴,第二列为 X 轴,希望 X 轴的输出顺序按照第二列由上到下排列。

size    type
6.612309456    T-8
5.878857613    T-10
6.724282265    T-15
5.68136692    T-56
5.863334656    T-1723


然而软件输出的顺序如下:

T-10    T-15    T-1723    T-56    T-8

解决方案:

通过一个因子事先自定义 X 轴顺序,作图命令如下:

#读入数据
gsize <- read.delim("gsize.txt", header=TRUE, sep="\t", stringsAsFactors=FALSE)
#自定义X轴顺序
x1 = factor(gsize$type, levels=c("T-8","T-10","T-15","T-56","T-1723"))
#用x1代替gsize$type绘图
boxplot(size~x1, data=gsize, xlab="Sequence Type", ylab="Genome Size", varwidth=TRUE, notch=FALSE)


至此,X 轴各项目会按照我们自定义的顺序排列。

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